Badania naukowe na Wydziale Inżynierii Zarządzania PB prowadzone są na najwyższym poziomie, co zostało docenione przez Komisję Ewaluacji Nauki w 2022 roku, która przyznała najwyższą w Polsce kategorię A w dyscyplinie nauki o zarządzaniu i jakości. Realizowane na WIZ PB badania naukowe mieszczą się w dziedzinie nauk społecznych, głównie w dyscyplinie nauk o zarządzaniu i jakości. Skupiają się na analizie i zrozumieniu różnych aspektów zarządzania organizacjami i regionem oraz doskonaleniu jakości ich funkcjonowania. Pomagają organizacjom oraz jednostkom samorządów terytorialnych lepiej zrozumieć swoje procesy, doskonalić działania, reagować na zmiany w otoczeniu biznesowym oraz dążyć do ciągłego ulepszania jakości swoich produktów i usług. Służą opracowaniu nowych strategii, narzędzi i praktyk, które przyczyniają się do osiągnięcia sukcesu i przewagi konkurencyjnej na rynku. Na WIZ PB rozwijane są cztery szkoły naukowe:
Obszary badawcze realizowane w ramach poszczególnych szkół naukowych WIZ PB stanowią odpowiedź na potrzeby odpowiedzialnego, zrównoważonego rozwoju we współczesnym świecie i korespondują z kluczowymi celami sformułowanymi w „Agendzie na rzecz zrównoważonego rozwoju 2030” Organizacji Narodów Zjednoczonych, obszarami horyzontalnymi „Strategii na Rzecz Odpowiedzialnego Rozwoju” polskiego państwa oraz celami strategicznymi i operacyjnymi zidentyfikowanymi w „Strategii Rozwoju Województwa Podlaskiego 2030”. Szkoły naukowe WIZ PB realizują badania lokujące się w następujących obszarach horyzontalnych „Strategii na Rzecz Odpowiedzialnego Rozwoju” polskiego państwa: kapitał ludzki i społeczny, cyfryzacja, transport, energia, środowisko. Ponadto badania prowadzone w ramach szkół naukowych nawiązują do wszystkich priorytetowych obszarów zidentyfikowanych w Strategii, takich jak: ekspansja międzynarodowa, przemysły przyszłości, rozwój małych i średnich przedsiębiorstw, partnerstwo publiczno-prywatne, partnerstwo inwestycyjne z samorządami, czy rozwój zrównoważony terytorialnie, ze szczególnym uwzględnieniem specjalnych stref ekonomicznych oraz inwestycji w obszarach dotychczas zaniedbanych. W kontekście „Strategii Rozwoju Województwa Podlaskiego 2030” badania szkół naukowych dotyczą wszystkich trzech, zidentyfikowanych celów strategicznych tj.: dynamicznej gospodarki, zasobnych mieszkańców i partnerskiego regionu i są bezpośrednio powiązane z większością celów operacyjnych np.: przemysł przyszłości, kompetentni mieszkańcy, dobre zarządzanie, kapitał społeczny.